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1.
J Med Virol ; 80(11): 2034-9, 2008 Nov.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-18814260

RESUMO

Group A rotaviruses are the main cause of acute gastroenteritis in children worldwide. The intermediate capsid protein VP6 encoded by segment 6 of the dsRNA genome is the major structural component of the virus and it is highly antigenic and immunogenic. VP6 is responsible for group and subgroup (SG) specificities, allowing classification of group A rotavirus into SG I, SG II, SG I + II, and SG non-I-non-II. VP6-encoding gene of 154 group A human rotavirus samples of different G and P genotypes recovered from children in three cities of Central West region of Brazil was amplified by reverse transcription-polymerase chain reaction followed by sequencing and phylogenetic analysis. Two distinct genetic groups could be recognized: VP6 genogroups I and II. Sequences analysis also revealed that all samples identified as VP6 genogroup I were associated with NSP4 genotype A, whereas samples identified as VP6 genogroup II were associated with NSP4 genotype B. This is the first study in Central West region regarding genetic variability of the VP6 gene. Further molecular surveillance of rotavirus strains is needed to understand better the occurrence of VP6 gene diversity in Brazil and the significance of VP6 for the control and prevention of rotavirus gastroenteritis.


Assuntos
Antígenos Virais/genética , Proteínas do Capsídeo/genética , Gastroenterite/epidemiologia , Gastroenterite/virologia , Infecções por Rotavirus/epidemiologia , Infecções por Rotavirus/virologia , Rotavirus/classificação , Rotavirus/isolamento & purificação , Sequência de Aminoácidos , Brasil/epidemiologia , Pré-Escolar , Análise por Conglomerados , Genótipo , Humanos , Epidemiologia Molecular , Dados de Sequência Molecular , Filogenia , RNA Viral/genética , Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa , Rotavirus/genética , Alinhamento de Sequência , Análise de Sequência de DNA , Homologia de Sequência
2.
Mem Inst Oswaldo Cruz ; 103(3): 288-94, 2008 May.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-18592101

RESUMO

Nonstructural protein 4 (NSP4), encoded by group A rotavirus genome segment 10, is a multifunctional protein and the first recognized virus-encoded enterotoxin. The NSP4 gene has been sequenced, and five distinct genetic groups have been described: genotypes A-E. NSP4 genotypes A, B, and C have been detected in humans. In this study, the NSP4-encoding gene of human rotavirus strains of different G and P genotypes collected from children between 1987 and 2003 in three cities of West Central region of Brazil was characterized. NSP4 gene of 153 rotavirus-positive fecal samples was amplified by reverse transcriptase-polymerase chain reaction and then sequenced. For phylogenetic analysis, NSP4 nucleotide sequences of these samples were compared to nucleotide sequences of reference strains available in GenBank. Two distinct NSP4 genotypes could be identified: 141 (92.2%) sequences clustered with NSP4 genotype B, and 12 sequences (7.8%) clustered with NSP4 genotype A. These results reinforce that further investigations are needed to assess the validity of NSP4 as a suitable target for epidemiologic surveillance of rotavirus infections and vaccine development.


Assuntos
Glicoproteínas/genética , Infecções por Rotavirus/virologia , Rotavirus/genética , Toxinas Biológicas/genética , Proteínas não Estruturais Virais/genética , Sequência de Bases , Brasil , Criança , Pré-Escolar , Fezes/virologia , Genótipo , Humanos , Filogenia , Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa , Rotavirus/classificação , Análise de Sequência de RNA
3.
Mem. Inst. Oswaldo Cruz ; 103(3): 288-294, May 2008. graf, tab
Artigo em Inglês | LILACS | ID: lil-485222

RESUMO

Nonstructural protein 4 (NSP4), encoded by group A rotavirus genome segment 10, is a multifunctional protein and the first recognized virus-encoded enterotoxin. The NSP4 gene has been sequenced, and five distinct genetic groups have been described: genotypes A-E. NSP4 genotypes A, B, and C have been detected in humans. In this study, the NSP4-encoding gene of human rotavirus strains of different G and P genotypes collected from children between 1987 and 2003 in three cities of West Central region of Brazil was characterized. NSP4 gene of 153 rotavirus-positive fecal samples was amplified by reverse transcriptase-polymerase chain reaction and then sequenced. For phylogenetic analysis, NSP4 nucleotide sequences of these samples were compared to nucleotide sequences of reference strains available in GenBank. Two distinct NSP4 genotypes could be identified: 141 (92.2 percent) sequences clustered with NSP4 genotype B, and 12 sequences (7.8 percent) clustered with NSP4 genotype A. These results reinforce that further investigations are needed to assess the validity of NSP4 as a suitable target for epidemiologic surveillance of rotavirus infections and vaccine development.


Assuntos
Criança , Pré-Escolar , Humanos , Glicoproteínas/genética , Infecções por Rotavirus/virologia , Rotavirus/genética , Toxinas Biológicas/genética , Proteínas não Estruturais Virais/genética , Sequência de Bases , Brasil , Fezes/virologia , Genótipo , Filogenia , Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa , Rotavirus/classificação , Análise de Sequência de RNA
4.
Rev. patol. trop ; 35(1): 1-21, jan.-abr. 2006. tab
Artigo em Português | LILACS | ID: lil-432229

RESUMO

A presente revisão descreve os aspectos básicos necessários para assegurar a qualidade higiênico-sanitária de carnes de origem bovina, mais especificamente sobre o hambúrguer pronto para o consumo, que é atualmente um dos alimentos produzidos em grande escala e de crescente consumo no Brasil. Os limites e padrões microbiológicos que devem ser adotados para garantir uma correta interpretação sobre os resultados das análises microbiológicas, os fatores que contribuem para a ocorrência de surtos de enfermidades de origem alimentar e a necessidade da implantação de sistemas de boas práticas de produção que visem identificar os perigos e os riscos microbiológicos são parâmetros importantes abordados ao longo deste trabalho. Além disso, são descritos os aspectos legais e os perigos bacterianos que comprometem a qualidade destes alimentos expostos à venda ou ao consumo, visando-se, sobretudo, prevenir ou minimizar o número de doenças veiculadas por alimentos, visto que estas representam um dos problemas de saúde pública mais difundidos no contexto mundial.


Assuntos
Humanos , Carne , Contaminação de Alimentos , Higiene dos Alimentos , Comportamento Alimentar , Microbiologia de Alimentos , Bovinos , Brasil/epidemiologia , Controle de Qualidade , Estados Unidos/epidemiologia
5.
Rev. patol. trop ; 34(2): 85-104, maio-ago. 2005.
Artigo em Português | LILACS | ID: lil-426779

RESUMO

Os vírus entéricos humanos são importantes causas de enfermidades veiculadas através da água. Esses patógenos, que são eliminados em grandes quantidades pelas fezes de indivíduos infectados, podem permanecer viáveis e infecciosos durante vários meses no ambiente e, assim, contaminar águas destinadas ao consumo humano, além de resistirem aos atuais processos de tratamento da água e do esgoto aplicados no controle bacteriano. Dessa forma, a qualidade de águas tratadas nem sempre é garantida em termos de segurança virológica, pois os atuais indicadores do grupo coliforme determinam somente a segurança bacteriológica da água. Os vírus são mais difíceis de serem detectados que as bactérias em amostras ambientais, especialmente em águas, nas quais estes microrganismos normalmente são encontrados em menor número. Sendo parasitas intracelulares obrigatórios, não se multiplicam: tornam-se necessárias, então, a análise de amostras de água volumosas e a escolha de métodos de concentração com grande eficiência de recuperação para as partículas virais. Além disso, muitos patógenos virais transmitidos através da água são microrganismos fastidiosos, que dificilmente são isolados pelos métodos tradicionais de rotina, como a cultura celular, o que torna ideal a utilização de técnicas de detecção muito sensíveis e que exijam complexas implementações. Com os avanços recentes nas técnicas laboratoriais em parâmetros de concentração viral e com a descoberta de métodos moleculares altamente sensíveis e específicos, como a reação em cadeia pela polimerase (PCR), tem sido possível aumentar o número de investigações no campo da virologia aquática. Isso provavelmente possibilitará a elaboração e a adoção de medidas preventivas que minimizem a contaminação da água por agentes virais que, até o momento, somente são realizadas em situações ocasionais de controle pelas autoridades sanitárias.


Assuntos
Humanos , Viroses , Ambiente Aquático , Qualidade da Água , Reação em Cadeia da Polimerase
6.
Rev. patol. trop ; 32(1): 45-52, jan.-jun. 2003. ilus, tab, graf
Artigo em Português | LILACS | ID: lil-387493

RESUMO

Com a finalidade de verificar a qualidade de hambúrgueres de carne bovina prontos para o consumo comercializados em sanduicherias tipo trailers da cidade de Goiânia (GO), foi realizada uma avaliação microbiológica de cem amostras. Estas foram coletadas com o apoio da Vigilância Sanitária Municipal, sendo cinqüenta oriundas de estabelecimentos de regiões centrais e cinqüenta de regiões periféricas. Posteriormente, foram analisadas com base na Resolução RDC nº 12, de 2 de janeiro de 2001, da Agência Nacional de Vigilância Sanitária. O protocolo microbiológico, de acordo com American Public Health Association - APHA (1992) e Brasil (1999), incluiu a contagem de coliformes a 45°C, Staphylococcus coagulase positiva e bactérias Clostridium sulfito redutores a 46°C, além da pesquisa de Salmonella sp. Procedeu-se ainda à contagem de bactérias mesófilas aeróbias estritas e/ou facultativas viáveis e coliformes a 35°C. Os resultados evidenciaram a presença de mesófilos em 95 por cento das amostras e de coliformes totais em 35 por cento; no entanto, coliformes fecais e Escherichia coli (1 por cento), Staphylococcus coagulase positiva (1 por cento) e Clostridium sulfito redutores (2 por cento) foram encontradas em menor proporção. Não foi detectada nenhuma espécie de Salmonella nas amostras analisadas. A pesquisa microbiológica realizada evidenciou a elevada qualidade microbiológica das amostras analisadas, pois 99 por cento delas apresentaram-se de acordo com a legislação vigente.


Assuntos
Humanos , Amostras de Alimentos , Qualidade dos Alimentos , Microbiologia de Alimentos , Carne , Contaminação de Alimentos , Bovinos
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